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Calculateur d'efficacité qPCR

Calculez l'efficacité d'amplification à partir de la pente d'une courbe standard qPCR.

 

Efficacité E
Efficacité (%)
Amplification (1+E)

À propos de ce calculateur

Utilisez ce calculateur comme contrôle de qualité de la course. Cent pour cent signifie que le produit double à chaque cycle. Prenez la pente d'un graphique du seuil de cycle (Ct) versus log₁₀ de la dilution, du nombre de copies ou d'une autre quantité connue.

L'efficacité E est 10^(−1/pente) − 1. Le pourcentage est E × 100. L'amplification est 1 + E (2,0 à 100 %). Une série de dilutions au 1:10 avec un doublement idéal a une pente d'environ −3,32. La pente doit être négative ; une pente positive ou nulle n'est pas une courbe standard valide.

Une efficacité acceptable est souvent citée près de 90–110 %, mais la fenêtre dépend de votre essai, de la chimie et du SOP du laboratoire. Ce calculateur ne juge pas la conformité ; il convertit seulement la pente.

Pente de la courbe standard : La pente de Ct versus log₁₀(quantité). Une série de dilutions 1:10 donne souvent environ −3,3 lorsque l'efficacité est proche de 100 %.

Efficacité E : Efficacité fractionnaire (1,0 = 100 %, 0,9 = 90 %).

Efficacité (%) : La même valeur en pourcentage.

Amplification (1+E) : Facteur d'augmentation par cycle.