Calcolatore di ligazione

Usa questo calcolatore per allestire una ligazione di cloning sticky o blunt quando conosci lunghezza e massa del vettore, lunghezza dell'inserto e quante molecole di inserto vuoi per molecola di vettore (spesso 3:1).

Il calcolo è: massa di inserto (ng) = (bp inserto ÷ bp vettore) × massa del vettore (ng) × rapporto molare inserto:vettore. Le lunghezze sono in coppie di basi e le masse in nanogrammi. La formula assume la stessa massa media per coppia di basi per vettore e inserto.

Si tratta di un allestimento a rapporto molare, non di una garanzia sul numero di colonie. Qualità degli enzimi, estremità e purezza del DNA restano importanti.

Lunghezza vettore (bp): Lunghezza del vettore o del backbone in coppie di basi.

Massa vettore (ng): Quanto DNA vettore metti in provetta, in nanogrammi.

Lunghezza inserto (bp): Lunghezza dell'inserto in coppie di basi.

Rapporto molare inserto:vettore: Molecole di inserto per molecola di vettore. 3 significa una ligazione 3:1.

Massa inserto (ng): Nanogrammi di DNA inserto da aggiungere a quella quantità di vettore.