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Calcolatore dell'efficienza qPCR

Calcola l'efficienza di amplificazione dalla pendenza della curva standard qPCR.

 

Efficienza E
Efficienza (%)
Amplificazione (1+E)

Info sul calcolatore

Usa questo calcolatore come controllo di qualità della corsa. Il 100% significa che il prodotto raddoppia a ogni ciclo. La pendenza arriva da un grafico della soglia di ciclo (Ct) contro il log₁₀ della diluizione, del numero di copie o di un'altra quantità nota.

L'efficienza E è 10^(−1/pendenza) − 1. La percentuale è E × 100. L'amplificazione è 1 + E (2,0 al 100%). Una serie di diluizioni 1:10 con raddoppio ideale ha una pendenza di circa −3,32. La pendenza deve essere negativa; una pendenza positiva o nulla non è una curva standard valida.

Un'efficienza accettabile è spesso indicata intorno al 90–110%, ma la finestra dipende dal saggio, dalla chimica e dalle SOP del laboratorio. Questo calcolatore non giudica esito positivo o negativo: converte solo la pendenza.

Pendenza della curva standard: La pendenza di Ct contro log₁₀(quantità). Una serie di diluizioni 1:10 dà spesso circa −3,3 quando l'efficienza è vicina al 100%.

Efficienza E: Efficienza frazionaria (1,0 = 100%, 0,9 = 90%).

Efficienza (%): Lo stesso valore in percentuale.

Amplificazione (1+E): Incremento per ciclo.